故事發(fā)生在第一部的四年之后，此時特警K（湯姆?李?瓊斯 飾）已經(jīng)退休，成為一名普通的郵局局長，而J（威爾?史密斯 飾）則繼續(xù)從事MIB的工作。
卡洛瑟星邪惡女王蛇蓮娜來到地球需找宇宙能量“薩塔之星”，占領(lǐng)了MIB的總部。而當(dāng)年逃亡到地球的薩塔公主蘿娜曾請求MIB把 “薩塔之星”藏在地球，全面負(fù)責(zé)這件事情的K為了地球的安全，拒絕了她。
面對來勢洶洶的蛇蓮娜，MIB派J去尋找k，調(diào)查當(dāng)年事件的真相，怎樣說服失去記憶的K相信外星人的存在，成了J面臨的第一個難題……